Theo tư liệu lịch sử còn sót lại, chùa Thiên Nối được xây dựng vào cuối thế kỷ XV – thời Lê Trung Hưng. Trải qua những thời gian “khắc nghiệt” với Phật giáo, chùa chiền miếu mão đều bị đập bỏ. Chùa Thiên Nối cũng không nằm ngoài hoàn cảnh đó. Lúc bấy giờ, toàn bộ tôn tượng còn sót lại được hợp tự tại chùa Hàn Nguyên, xã An Lộc ngày nay. Tại khuôn viên vùng đất của chùa vẫn còn ngôi mộ Sư cô Thanh Lan, (tương truyền sư cô thọ 112 tuổi, sư tịch vì tự thiêu, không rõ nguyên nhân).
Với lòng kính tin Tam Bảo, với nhân duyên của cả một vùng đất thiêng Phật giáo huyện Lộc Hà, hàng tháng nhân dân, bà con Phật tử vẫn về đây hương khói trên vị trí nền đất của chùa.
Toàn cảnh ngôi chùa Thiên Nối vừa được phục dựng (bên hông là ngôi mộ Sư cô Thanh Lan).
Với mong muốn của bà con nhân dân là trùng tu kiến thiết lại ngôi chùa, từ năm 2012 lại nay chính quyền địa phương đã chấp nhận cho thành lập Ban kiến thiết để bà con nhân dân, Phật tử trên địa bàn có cơ hội đóng góp xây dựng lại ngôi chùa.
Từ những tấm lòng, từ những ngày công và đồng tiền gom góp sau mỗi mùa vụ thu hoạch lúa, hình dáng một cơ sở tâm linh đang bắt đầu hình thành trên vùng quê nghèo đây cũng là tấm lòng thể hiện tinh thần tri ân với các bậc tiền nhân đã có công lập dựng nên ngôi cổ tự này.
Mặc dầu quy mô và khuôn viên chùa còn nhỏ, nhưng theo Ông Nguyễn Đình Qùy – PCT UBND xã - Trưởng ban kiến thiết tổng kinh phí trùng tu cho đến nay đã gần 700 triệu đồng một con số khá lớn cho sự đóng góp của bà con nhân dân vùng quê nghèo Bình Lộc.
Cũng tại đây, sáng ngày ngày 12/6/Ất Mùi, đạo tràng Phật tử nơi đây đã thỉnh mời Đại đức Thích Tâm Quang, Trưởng ban Trị sự GHPGVN huyện Lộc Hà, trang nghiêm tổ chức lễ an vị tôn tượng được thiết trí tại chùa bấy lâu nay.
Theo khảo sát và địa dư chí Hà Tĩnh vốn có bề dày lịch sử về Phật giáo, thời phục hưng của thập niên 40 - 50 trên vùng đất nhỏ bé này đã có hàng trăm ngôi chùa, và nhiều vị chân tu trú xứ. Hiện nay rất nhiều ngôi chùa nhiều Di tích vẫn còn chưa thể khôi phục, chưa thể trùng tu do cuộc sống của người dân còn nhiều khó khăn, các cơ sở pháp lý đã bị thất lạc mất mát.
