Chưa rõ chùa dựng từ bao giờ, chỉ biết hai lần trùng tu là vào đời Tự Đức và năm 1925 đời Khải Định.
Chùa ở đượng/nương Lòi Mồ, địa phận xóm Nhân Phố, có ngôi nhà ba gian gỗ mít lợp tranh. Trong chùa có một số tượng Phật sơn son, thiếp vàng. “Hương ước thôn Gia Phổ” lập năm Khải Định thứ 5 (1920) sao lại năm Bảo Đại thứ 17 (1942) ghi “vườn, ruộng chùa có 2 mẫu 5 sào ở xứ Tai Chó – Gia Huyền”.
Trong trận bão lớn năm 1932, chùa bị đổ sập nát.
Năm 1933, chùa được xây lại bằng đá ong theo kiểu trùng diêm, dài 4,90m, rộng 3,50m, cao 5,30m, hai tầng, 8 mái uốn cong, thành ngôi nhà dọc, tường hai bên và phía sau trát kín, phía trước trổ cửa tò vò ở mỗi tầng. Ở tầng trên, trên cửa đắp biển đề ba chữ Hán Phúc Linh tự. Tầng đưới cửa rộng 1,60m, cao 2,20m, trên kẻ bốn chữ quốc ngữ Không tham là phúc, hai bên cột có câu đối chữ Hán: Nhất thiết chúng sinh khai giác lộ, Tam thiên thế giới độ mê tân. (Một niềm vì chúng sinh mở con đường giác, Ba nghìn thế giới qua khỏi bến mê.)
Năm 1934 có trận lụt lớn, đền chùa miếu mạo trong thôn bị trôi, dân làng chuyển ngôi đền về vùng này, dựng bên chùa và nhà Thánh Mẫu, thành một cụm kiến trúc ba công trình thờ tự, trong một khu vườn rộng trồng cây ăn quả và chè xanh, có hàng rào tre hóp dày bao quanh.
Trong kháng chiến chống Pháp 1946 – 1954, khu vườn này trở thành xưởng vũ khí, rồi Trường trung học miền Nam. Chùa đền bị bỏ hoang phế, hư hỏng.
Từ năm 1996 đến nay, chùa Phúc Linh được tu sửa lại, đặt thêm tượng Phật, tự khí… Cụm di tích đền chùa này được phục hồi và được công nhận là “Di tích lịch sử văn hóa” cấp Tỉnh
- Trích sách “Chùa cổ Hà Tĩnh”, tác giả Thái Kim Đỉnh
